Diagnóstico molecular de Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson en Venezuela, agente causal de la escaldadura foliar de la caña de azúcar

Beatriz Alvez; Jeismar Carballo; Guillermina Alonso; Maira Oropeza

Beatriz Alvez Universidad Central de Venezuela (UCV), Instituto de Botánica Agrícola, Maracay. Venezuela.
Jeismar Carballo Instituto de Estudios Avanzados (IDEA), estado Miranda. Venezuela
Guillermina Alonso Universidad Central de Venezuela (UCV), Facultad de Ciencias, Instituto de Biología Experimental. Caracas. Venezuela.
Maira Oropeza Universidad Central de Venezuela (UCV), Facultad de Ciencias, Instituto de Biología Experimental. Caracas. Venezuela.

Palabras clave: Saccharum sp., pruebas bioquímicas, PCR, genotipificación

Resumen

La escaldadura foliar (EF) causada por Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson, es una de las enfermedades de mayor importancia en el cultivo de la caña de azúcar, Saccharum sp., ocasionando pérdidas estimadas entre 90-100% de la producción. El uso de la reacción en cadena de la polimerasa (por sus siglas en inglés pcR) como herramienta de diagnóstico de fitopatógenos se incrementó a nivel mundial dada su rapidez, sensibilidad y especificidad. Dada la importancia que tiene esta enfermedad en Venezuela, se llevó a cabo el diagnóstico de la bacteria a partir de plantas de caña de azúcar sintomáticas, empleando pruebas microbiológicas, bioquímicas y moleculares. Utilizando diversos métodos de purificación se obtuvieron aislados bacterianos, los cuales se sometieron a análisis fenotípicos y bioquímicos, así como a ensayos de PCR con iniciadores específicos y las secuencias consenso repetitivas intragénicas de enterobacterias (siglas en inglés ERIC-PCR). con el método de macerado de hojas se obtuvieron 50 aislados, de los cuales 14 se seleccionaron por pruebas microbiológicas y bioquímicas, de estos, sólo tres cepas fueron identificadas como X. albilineans. Este resultado se corroboró al obtener por pcR la banda esperada de 360 pb con los iniciadores específicos sólo en estos tres aislados. Finalmente, con la técnica de genotipificación ERIC-PCR se obtuvieron patrones de bandas para las bacterias identificadas como X. albilineans que no son similares a los descritos por otros autores en otras regiones del mundo. Este trabajo representa la primera genotipificación de aislados de X. albilineans en Venezuela.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Citas

• Araque, Y., J. Vitelli-Flores, A. Ramírez, G. Alonso y V. Rodríguez Lemoine. 2008. Identificación bioquímica y PCR especie-específica de Burkholderia cepacia en muestras de origen hospitalario y ambiental en Venezuela. Rev Soc Ven Microbiol. 28:82-89.

• Birch, R. 2001. Xanthomonas albilineans and the anti- pathogenesis approach to disease control. Mol plant Pathol. 2:1-11.

• Carballo, J., M. Raymundez y M. Oropeza. 2007. Efecto de la infección de Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson, sobre la estructura anatómica de la hoja en caña de azúcar (Saccharum sp.) variedad R8 85-554b; XVII Congreso Venezolano Botánica. 20:330-333.

• Cova, J., H. Nass y A. Orozco. 2006. Enfermedades de la caña de azúcar (Saccharum spp) presentes en el estado portuguesa durante el período 2003-2005; CENIAP HOY, N° 10: Dsponible en: https://bit.ly/3bwrCWF

• Davis, M., p. Rott, p. Baudin and J. Dean. 1994. Eva- luation of selective media and immunoassays for detection of Xanthomonas albilineans, causal agent of sugarcane leaf scald disease. Plant Dis. 78:78-82.

• Díaz g. 2003. Fundamentos y técnicas de análisis micro- biológico. Protocolos de pruebas de identificación bacteriana. Laboratorio de Diagnóstico clínico. 2º curso (2003-2004). San Fernando de Henares, Madrid, 9-16 pp.

• Gomes, L, K. Roncato, F. Aandrino and F. Almeida.2000. A simple method for DNA isolation from Xanthomonas spp. Sci Agric. 57:553-555.

• Honeycutt, R., B. Sobral and M. Mcclelland. 1995. tRNA intergenic spacers reveal polymorphisms diagnostic for Xanthomonas albilineans. Microbiol.141:3 229-3 239.

• Hoy, J. and M. Grisham. 1994. Sugarcane leaf scald distribution, symptomatology, and effect on yield in Louisiana. Plant Dis. 78:1 083-1 087.

• Huerta, M., L. Ortega, C. Landeros, L. Fucikovsky y M.Marín. 2003. Respuesta de 10 variedades de caña de azúcar a la EF de la hoja [Xanthomonas albilineans (Sabih) Dowson], en la región central costera de Veracruz. Agrociencia. 37:511-519.

• Jensen, M., J. Webster and N. Straus. 1993. Rapid identification of bacteria on the basis of polymerase chain reaction-amplified ribosomal DNA spacer polymorphisms. Appl Environ Microbiol. 59:945-952.

• Jiménez, O. y N. contreras. 2004. Xanthomonas albi- lineans agente causal de la escaldadura foliar de la caña de azúcar (Saccharum sp.) en los estados Lara y Yaracuy. Rev Fac Agron. 21:231-243.

• Jiménez, O. y N. Contreras. 2008. Detección de Xanthomonas albilineans agente causal de la escaldadura foliar de la caña de azúcar usando la técnica de ELISA y medios selectivos. Bioagro. 20:209-213.

• Jiménez, O. y N. Contreras. 2009. Respuesta de 11 variedades de caña de azúcar a la escaldadura foliar (Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson) y eva- luación de dos métodos de inoculación. Bioagro. 21:139-142.

• Kado, C. and M. Heskett. 1970. Selective media isolation of Agrobacterium, Corynebacterium, Erwinia, Pseudomonas, and Xanthomonas; phytopathol.60:969-976.

• Lopes, S., K. Damann and L. Grelen. 2001. Xanthomonas albilineans diversity and identification based on Rep-PCR fingerprint. Curr Microbiol. 42:155-159.

• Lu, J., C. Perng, S. Lee and C. Wan. 2000. Use of PCR with universal primers and restriction endonuclease digestions for detection and identification of common bacterial pathogens in cerebrospinal fluid. J Clin Microbiol. 38:2 076-2 080.

• Ordosgoitti, A., A. Manzano y A. piñero. 1977. La escaldadura de la caña de azúcar en Venezuela. Agronomía Trop. 27:235-249.

• Pan, Y., M. Grisham and D. Burder. 1997.A polymerase chain reaction protocol for the detection of Xanthomonas albilineans, the causal agent of sugarcane leaf scald disease. Plant Dis. 81:189-94.

• Ricaud, C. and C. Ryan. 1989. Leaf scald: Diseases of sugarcane. Major diseases. Eds: Ricaud C, Egan B, Gillaspie A Jr y Hughes C. Amsterdan. The Nether- lands; Elsevier Science Publishers; 39-58.

• Rivas, J., C. Redondo y G. Alonso. 2006. Genotipificación de cepas de enterobacterias procedentes de 4 centros de salud del área de Caracas. Acta Científica de la Sociedad Venezolana de Bioanalistas Especia- listas. 9(2):3-7.

• Sambrook, J. and D. Russell. 2001. Molecular cloning a laboratory manual. cold Spring Harbor Laboratory Press. Third edition, 5.4, 5.14.

• Silva, M., I. Bedendo e M. Casagrande. 2005. caracte- rização molecular e patogêncica de isolados de Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson agente causal escaldadura da cana de açúcar. Summa phyto- pathol. 33:341-347.

• Schaad, N., J. Jones and W. Chun. 2001. laboratory guide for identification of plant pathogenic bacteria, St. Paul: phytopathological Society press. 373 pp.

• Swings, J. and E. Civerolo. 1993. Xanthomonas. First edition. Chapman y Hall. London. 399 p.

• Vilchez, G. y G.. Alonso. 2009. Alcances y limitaciones de los métodos de epidemiología molecular basados en el análisis de ácidos nucleicos. Revista de la Sociedad Venezolana de Microbiología. 29:6-12.

• Versalovic, J., M. Schneider, F. J. De Brujin and J. R.Lupski. 1994. Genomic fingerprinting of Bacteria Using Repetitive Sequence-Based polymerase chain Reaction. Methods in Molecular and Cellular Biology. 5(1):25-40.

Diagnóstico molecular de Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson en Venezuela, agente causal de la escaldadura foliar de la caña de azúcar

Resumen

Descargas

Citas

Instrucciones a los Autores